En Seconde, Première et Terminale, le lycée Fénelon propose trois options facultatives :
* Italien LV3
* Théâtre
* Latin
En Première et Terminale, deux options s'ajoutent à cette liste :
* Mathématiques complémentaires (pour les élèves qui abandonnent la spécialité Mathématiques en Terminale)
* Mathématiques Expertes (pour les élèves qui conservent la spécialité Mathématiques en Terminale)