Le rôle des CPE est de placer les élèves dans les meilleures conditions pour réussir leur scolarité et de contribuer à leur épanouissement personnel ainsi qu'à la construction de leur future vie de citoyen. Ils veillent en particulier à ce que tout se passe bien dans les moments où les élèves ne sont pas en cours.
Pour ce faire, les CPE sont responsables de la gestion de la Vie Scolaire (contrôle des flux d'entrée/sortie, gestion absences et retards, récréation, demi-pension, les temps de permanence et d'études dirigées...).
Les CPE assurent le suivi des élèves et de leur scolarité en collaboration avec les enseignants, l'équipe médico-sociale et les familles autant au niveau individuel (comportement, travail, problèmes personnels, conseil) que collectif (suivi des classes avec les Professeurs Principaux).
Ils organisent et participent à l'animation socio-éducative de l'établissement et également à l'éducation à la citoyenneté (formation des délégués de classe, interventions extérieures pour des séances de prévention etc.)